Pemerintah Desa Ngabean terdiri dari Kepala Desa dan Perangkat Desa Ngabean.
Struktur Organisasi dan Tata Kerja Pemerintah Desa Ngabean periode 2007-2013 adalah :
I. Tahun 2007-2010 Terdiri dari :
- Yuly Hermawan Susilo, AMK ( Kepala Desa )
- Wahadiya ( Sekretaris Desa )
- Achmad Amin ( Kaur Umum )
- Arfan Maghfur ( Kaur Keuangan )
- Samsudini ( Kaur Pemerintahan )
- Sudarman ( Kaur Pembangunan )
- M. Sanusi ( Kaur Kesejahteraan Rakyat )
- Zaenal ( Kepala Dusun Krajan )
- Muslih ( Kepala Dusun Komprengan )
- Fathurrohman ( Kepala Dusun Senobayan )
- S. Sutrisno ( Kepala Dusun Kenayan )
- Asrofi ( Kepala Dusun Batu )
- Widodo ( Pembantu Kaur Kesra )
- Nasrun ( Pembantu Kaur Kesra )
II. Tahun 2010-2012
- Yuly Hermawan Susilo, AMK ( Kepala Desa )
- Wahadiya ( Sekretaris Desa )
- Ruri Apri S ( Kaur Umum )
- Arfan Maghfur ( Kaur Keuangan )
- Samsudini ( Kasi Pemerintahan )
- Muh Amin Haryanto ( Kasi Pembangunan )
- Edy Pamuji Widodo ( Kasi Kesejahteraan Rakyat )
- Zaenal ( Kepala Dusun Krajan )
- Muslih ( Kepala Dusun Komprengan )
- Fathurrohman ( Kepala Dusun Senobayan )
- S. Sutrisno ( Kepala Dusun Kenayan )
- Asrofi ( Kepala Dusun Batu )
- Widodo ( Pembantu Kaur Kesra )
- Nasrun ( Pembantu Kaur Kesra )
III. Tahun 2012-2013
- Yuly Hermawan Susilo, AMK ( Kepala Desa )
- Wahadiya ( Sekretaris Desa )
- Ruri Apri S ( Kaur Umum )
- Arfan Maghfur ( Kaur Keuangan )
- Samsudini ( Kasi Pemerintahan )
- Muh Amin Haryanto ( Kasi Pembangunan )
- Edy Pamuji Widodo ( Kasi Kesejahteraan Rakyat )
- Zaenal ( Kepala Dusun Krajan )
- Muslih ( Kepala Dusun Komprengan )
- Fathurrohman ( Kepala Dusun Senobayan )
- Arif Yuniyanto ( Kepala Dusun Kenayan )
- Asrofi ( Kepala Dusun Batu )
- Widodo ( Pembantu Kasi Kesra )
- Nasrun ( Pembantu Kasi Kesra )
Pada Tahun 2010 ada 3 Kepala Urusan yang telah purna karena habis masa jabatannya, sehingga diadakan penerimaan Perangkat Desa baru. Dari hasil seleksi terpilih 3 Perangkat Desa baru yaitu : Ruri Apri Setyowati ( Kaur Umum ) Muh Amin Haryanto ( Kasi Pembangunan ) dan Edy Pamuji Widodo ( Kasi Kesejahteraan Rakyat ).
Dan pada tanggal 10 Januari 2012 Kepala Dusun Kenayan ( Bp. S. Sutrisno ) mengakhiri masa jabatannya dan setelah diadakan Pemilihan Kepala Dusun Kenayan pada tanggal 27 Mei 2012 terpilihlah Bp Arif Yuniyanto sebagai Kepala Dusun Kenayan periode Tahun 2012-2027.
Pingback: Arif Yuniyanto Terpilih Sebagai Kepala Dusun Kenayan | Desa Ngabean